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CY3标记16S-rRNA,花菁染料CY3共价修饰于16S核糖体RNA分子的反应条件

2025-07-28 分享

CY3标记16S-rRNA,花菁染料CY3共价修饰于16S核糖体RNA分子的反应条件

CY3-16S-rRNA 是将花菁染料CY3共价修饰于16S核糖体RNA分子的荧光标记物,常用于微生物群落分析、核酸杂交、探针追踪和原位分子检测等应用场景。16S rRNA 是细菌核糖体中保守而具变异区域的RNA序列,适合作为物种识别和分类的分子标志,而CY3标记则赋予其可视化和检测能力,使其在实验中实现高灵敏荧光响应。

在合成或标记反应条件上,通常使用含氨基修饰的寡核苷酸探针与CY3-NHS酯或CY3-maleimide等反应活性染料进行偶联。16S rRNA 本身为RNA大分子,直接标记较困难,因此多采用以下策略:首先通过体外转录制备带有标记位点的16S rRNA,或利用DNA探针识别特定位点进行间接标记。具体反应条件如下:

溶剂环境:常在碳酸盐缓冲液(0.1 M, pH 8.5)中进行,以保证NHS酯类反应效率;

温度条件:室温至37°C,反应时间约2~4小时;

染料比例:通常选用1.5~3等摩尔比例的CY3-NHS与RNA上的氨基进行标记;

纯化方式:通过乙醇沉淀、HPLC或凝胶过滤去除未反应的染料,得到高纯度的CY3标记RNA产物;

验证方法:使用UV-Vis吸收光谱和荧光检测进行标记度评估,典型CY3吸收峰在550 nm,发射峰在570 nm。

CY3-16S-rRNA 可用于荧光原位杂交(FISH)技术中对菌群分布进行定位,或结合微阵列芯片用于定量检测。其标记后的RNA分子具备良好的荧光信号、不影响其序列识别能力,适合用于高通量筛查、生态多样性分析和纳米载体构建等分子生物学实验。通过优化反应条件和RNA序列选择,可进一步提升其荧光信噪比和空间分辨率,是研究核酸功能与相互作用的关键工具之一。

产品名称:CY3标记16S-rRNA

纯度:95%+

规格:mg/g

用途:科研

状态:固体/粉末/溶液

CY3标记16S-rRNA

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仅用于科研,不能用于人体。小编axc