CY5.5标记精氨酸,CY5.5-Arginine的化学反应原理
CY5.5标记精氨酸,CY5.5-Arginine的化学反应原理
精氨酸(Arginine)是一种带有碱性侧链的氨基酸,含有独特的胍基官能团,具有多种化学反应活性。利用CY5.5荧光染料标记精氨酸,常见的化学反应涉及其氨基、胍基或羧基与染料活性官能团的共价结合。深入理解反应原理有助于高效合成标记物。
1. 精氨酸的结构与活性官能团
精氨酸分子包含α-氨基、α-羧基和带正电的胍侧链。
胍基具有较强的碱性和亲核性,是特异性反应的重要位点之一。
氨基和羧基分别能参与酰胺键形成和酯键生成。
2. CY5.5标记的主要化学反应类型
NHS酯与氨基的反应:CY5.5以NHS酯形式存在时,优先与精氨酸的α-氨基或侧链胍基的氨基发生亲核加成,形成酰胺键。
异氰酸酯与胺反应:某些特殊CY5.5衍生物可能通过异氰酸酯与胍基发生加成反应。
羧基活化与偶联:羧基可通过EDC/NHS等偶联剂活化后与染料的氨基反应,形成酰胺键。
3. 反应机理详解
CY5.5-NHS酯的碳酰碳受精氨酸的氨基亲核攻击,形成四面体中间体。
随后中间体释放NHS基团,生成稳定的酰胺键。
该反应具有高效性和选择性,适合温和条件下操作。
4. 胍基的特殊反应活性
胍基的多重共振结构赋予其较高的稳定性,但在特定条件下可发生加成反应。
胍基与某些活性基团的反应可用于设计靶向和特异性标记体系。
反应条件需控制以避免多点标记导致分子异构。
5. 反应条件影响因素
pH值对精氨酸的质子化状态及氨基的亲核活性有重要影响,佳反应pH一般在7.0~9.0。
温度控制在室温以保证反应温和进行,避免分子降解。
反应时间根据底物浓度和催化剂不同而变化,一般数小时至过夜。
6. 产物纯化与表征
通过高效液相色谱(HPLC)分离纯化标记产物。
质谱(MS)确认分子量及标记位置。
紫外-可见及荧光光谱检测标记效率和染料特性。
产品名称:CY5.5标记精氨酸,CY5.5-Arginine
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
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仅用于科研,不能用于人体。小编axc