6-HEX Phosphoramidite，1360547-55-2的反应机制
6-HEX Phosphoramidite，1360547-55-2的反应机制
6-HEX Phosphoramidite（CAS号：1360547-55-2）是一种用于寡核苷酸合成的荧光标记试剂，常用于实时荧光定量PCR（qPCR）、分子探针、毛细管电泳（CE）和基因组学研究中。作为5′-Hexachlorofluorescein（HEX）荧光染料的磷酰胺化衍生物，其结构和反应机制在合成过程中起着关键作用。
反应机制
在寡核苷酸合成中，6-HEX Phosphoramidite作为一个磷酰胺化试剂，参与合成过程中的加成反应。其反应机制可概括为以下几个步骤：
去保护：首先，去除固相支持物上的5′-保护基团（通常为DMT基团），暴露出5′-羟基。
活化：使用活化试剂（如氯化氮（NCl₃）或氯化氮/二甲基亚砜（DMSO）混合物）对6-HEX Phosphoramidite进行活化，生成一个具有高反应性的中间体。
加成：活化后的6-HEX Phosphoramidite与固相支持物上的5′-羟基发生亲核加成反应，形成一个新的磷酸二酯键。
氧化：为了稳定新形成的磷酸二酯键，通常使用氧化剂（如碘化吡啶）进行氧化，生成稳定的磷酸酯结构。
这一系列反应步骤确保了6-HEX荧光标记的寡核苷酸的合成效率和准确性。
三、应用领域
6-HEX Phosphoramidite广泛应用于以下领域：
实时荧光定量PCR（qPCR）：作为荧光探针的标记物，6-HEX用于实时监测PCR扩增过程。
分子探针：用于杂交探针的合成，检测特定的核酸序列。
基因组学研究：在基因表达分析和突变检测中，作为荧光标记的工具。
毛细管电泳（CE）分析：用于DNA片段的分离和分析。
产品名称：6-HEX Phosphoramidite
纯度：95%+
规格：mg/g
用途：科研
推荐产品：
FITC-Chondroitin sulfate，FITC-硫酸软骨素
水溶性CY5-甘氨胆酸，Sulfo CY5-Cholylglycine
CY5.5-脱氧胆酸，Cy5.5-Deoxycholic Acid
CY5-10-Gingerol，CY5-10-姜酚
CY5-直链淀粉，CY5-Amylose探针
仅用于科研，不能用于人体。小编axc