​Cy3 Amidite，Cy3 亚磷酰胺的实验用途

Cy3 Amidite，Cy3 亚磷酰胺的实验用途

Cy3 亚磷酰胺，英文名 Cy3 Amidite，中文可称为 Cy3 核苷亚磷酰胺衍生物，是一种用于寡核苷酸化学合成中的荧光修饰试剂，属于 Cyanine3 荧光染料家族。Cy3 荧光染料具有吸收峰约在 550 nm，发射峰约在 570 nm，红橙色荧光强度高且光稳定性好，适合于核酸标记和分子示踪实验。亚磷酰胺衍生物（Amidite）形式使 Cy3 可直接引入到寡核苷酸的 5′ 端、3′ 端或内部位点，实现化学合成时的可控荧光标记。

化学结构上，Cy3 Amidite 包括三部分：Cy3 荧光核心、核苷连接臂以及亚磷酰胺活性基团。荧光核心为长共轭 π 系统的 Cyanine3 结构，提供稳定的吸收和发射光谱。核苷连接臂使染料可以与寡核苷酸序列形成共价连接，保证标记的空间灵活性并减少对核酸结构的干扰。亚磷酰胺活性基团在 DNA/RNA 化学合成条件下与核苷酸单体发生硅氧基保护化学反应，实现荧光染料的共价引入。

实验用途方面，Cy3 亚磷酰胺主要用于寡核苷酸荧光标记及相关分子实验。它可用于 DNA、RNA 的 5′ 端或 3′ 端标记，也可通过内部碱基修饰实现链内标记。标记后的寡核苷酸可用于荧光杂交实验、实时 PCR（qPCR）、分子探针、FISH（原位杂交）、分子间相互作用研究以及核酸动力学分析等。Cy3 的红橙色荧光便于多通道成像，与其他波长荧光染料组合使用可实现多重标记分析。

使用 Cy3 Amidite 时，通常作为固相 DNA 合成的最后一个单体加入。合成条件包括磷酰胺化、氧化和脱保护步骤。染料在有机溶剂中稳定，适用于自动化 DNA/RNA 合成平台。标记完成后，通过去除保护基和纯化步骤（如高效液相色谱或PAGE凝胶纯化）获得纯净荧光标记寡核苷酸。纯化后的标记产物可在缓冲液或水相中长期保持荧光性能，适合下游实验使用。

Cy3 Amidite 的优势包括：1）荧光亮度高且光稳定性好，适合长期观测；2）化学合成中引入灵活，可标记寡核苷酸的任意端或内部位点；3）兼容自动化合成系统，便于大规模制备；4）标记后寡核苷酸稳定，可直接用于杂交、探针分析和分子相互作用实验。通过与 DNA 或 RNA 偶联，Cy3 荧光信号可用于检测、定量、空间定位及动态追踪。

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产品名称：Cy3 Amidite

纯度：95%+

规格：mg/g

用途：科研

厂家：良林生物

产品目录

花菁染料CY5标记阿西替尼 Cy5-Axitinib

花菁染料CY5标记爱帕琳肽；CY5-Apelin-36，rat, mouse，

花菁染料CY5标记氨基蝶呤 Cy5-Aminopterin

花菁染料CY5标记胺 CY5-NH2 1807529-70-9

花菁染料CY5标记奥拉帕尼 Cy5-Olaparib

仅用于科研，不能用于人体。小编axc