Propargyl-C1-NHS ester,炔丙基-一碳烷基-活性酯,CAS号132178-37-1
Propargyl-C1-NHS ester,炔丙基-一碳烷基-活性酯,CAS号132178-37-1,也常被记作Alkyne-C1-NHS、Propiolic acid NHS ester、2-Propynoic acid N-hydroxysuccinimide ester,是一款结构极简、反应活性*高的小分子生物正交标记试剂。它的分子结构仅由炔丙基、一个直接相连的羰基以及N-羟基琥珀酰亚胺活性酯基团组成,没有额外的烷基或聚乙二醇间隔链,整体分子体积非常小,是目前商业化可得的分子量*小的炔基活性酯类试剂之一。
这款化合物的核心反应特性来自两端的官能团组合:NHS活性酯端基可以在弱碱性的水相缓冲体系中,与伯氨基发生高效的亲核取代反应,形成稳定的酰胺键,反应过程中仅释放N-羟基琥珀酰亚胺小分子副产物,几乎不会对目标分子的结构产生额外影响;另一端的末端炔基则可以在后续的铜催化点击化学反应中,与带有叠氮基团的荧光探针、生物素等报告分子发生特异性连接,实现对目标分子的后续示踪与富集。由于分子中间没有额外的间隔臂,它的整体空间位阻*低,能够轻松进入很多大分子内部的狭小活性位点,完成其他大体积标记试剂无法实现的定点标记。
在蛋白质组学的基础研究中,这款小分子炔基试剂常被用于蛋白质氨基的全局标记实验。很多膜蛋白、组蛋白的表面氨基位点被复杂的三维结构包裹,大体积的PEG类炔基活性酯很难靠近完成修饰,而这款*小体积的C1型炔基活性酯,能够高效渗透进蛋白的折叠缝隙中,对所有可及的氨基位点进行全面标记,后续通过点击化学反应连接生物素探针,就可以将这些标记后的蛋白从复杂的样本体系中精准富集出来,*大提升低丰度蛋白的检出效率。在代谢小分子的标记研究中,它也被用于修饰带有氨基的代谢物,给原本没有特征标记基团的小分子带上炔基标签,后续通过点击化学反应连接荧光基团,就可以在薄层色谱、凝胶成像体系中直接观察到这些小分子的分布与迁移情况。这款试剂需要在无水低温条件下密封保存,遇水会缓慢水解失活,在实际使用时通常现配现用,避免长时间暴露在高湿度环境中影响反应活性,是生物正交标记领域一款不可替代的高活性小分子砌块。

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