CY3 COOH Cy3 Carboxylic Acid Cy3-羧基

CY3  COOH

1. 化学结构与性质

化学结构：Cy3 是一种含有两个共轭多环结构的氰基荧光染料，末端修饰为羧基（-COOH），易于与胺类分子反应。

分子量：取决于具体衍生形式（通常为 600-800 Da）。

溶解性：

易溶于有机溶剂（如 DMSO、DMF）。

一些修饰形式可溶于水。

2. 光学特性

参数 数值

激发波长 ~550 nm

发射波长 ~570 nm

摩尔消光系数 ~150,000 M⁻¹cm⁻¹

量子产率 中等偏高（~0.1-0.2）

在橙红色光谱范围有明亮荧光。

优良的光稳定性，适用于长时间的荧光检测。

3. 反应与功能

反应基团：

羧基（-COOH）可与胺类分子通过 EDC/NHS 化学形成酰胺键，适用于标记蛋白质、抗体、小分子或核酸等。

激活步骤（EDC/NHS 方法）：

将 Cy3-COOH 与 EDC 和 NHS 混合，生成 NHS 酯活化中间体。

活化后与目标分子（含胺基）反应，生成稳定的酰胺键。

副产物水溶性强，易去除。

4. 应用领域

生物标记：标记蛋白质、抗体、寡核苷酸、肽。

荧光成像：

荧光显微镜检测。

活体或离体组织染色。

FRET（荧光共振能量转移）实验：

可作为供体或受体，与其他染料（如 Cy5）配对。

流式细胞术：作为染料用于多色检测。