LG-PEG10-click-DBCO-Oleic,PROTAC linker连接子
产品名称:LG-PEG10-click-DBCO-Oleic,PROTAC linker连接子
一、基本结构
名称:LG-PEG10-click-DBCO-Oleic
类型:PROTAC linker(蛋白降解靶向嵌合体连接子)
化学结构:该连接子包含PEG链(长度为10个单位)、DBCO(二苯并环辛炔)点击化学基团以及Oleic(油酸)或相关基团。
分子量:1407.68(根据化学结构计算得出)
分子式:C70H114N6O23
二、化学结构特点
DBCO基团:DBCO是一种高效的点击化学反应基团,能够与含有叠氮基团的化合物发生无铜点击反应(SPAAC),形成稳定的1,2,3-三唑环结构。这种反应具有高度的选择性和生物相容性,使得DBCO成为生物偶联和药物修饰中的理想基团。
PEG链:PEG链的引入不仅增加了化合物的水溶性,还提高了其生物相容性和稳定性。PEG链的长度(本例中为10个单位)可以根据需要进行调整,以适应不同的应用需求。此外,PEG链的柔性也使得连接子能够更好地适应靶蛋白和E3连接酶之间的空间构型。
Oleic基团:Oleic基团可能提供了特定的生物活性或物理化学性质,如疏水性,有助于分子在细胞内的定位或作用。这种性质使得LG-PEG10-click-DBCO-Oleic在细胞内具有更好的靶向性和稳定性。
三、应用与功能
作为PROTAC linker,LG-PEG10-click-DBCO-Oleic连接了PROTAC分子中的靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。这种连接使得PROTAC分子能够同时与靶蛋白和E3连接酶结合,形成三元复合物,从而触发靶蛋白的泛素化和降解。
具体来说,LG-PEG10-click-DBCO-Oleic在PROTAC设计中的作用包括:
连接功能:连接靶蛋白配体和E3连接酶配体,形成稳定的三元复合物。
优化空间构型:通过调整PEG链的长度和Oleic基团的性质,优化靶蛋白和E3连接酶之间的空间构型,提高PROTAC的活性。
提高生物相容性和稳定性:PEG链和Oleic基团的引入增加了化合物的生物相容性和稳定性,使其在细胞内保持活性。