CY3标记反义寡核苷酸，CY3-AS-ODN的合成步骤概述

CY3标记反义寡核苷酸，CY3-AS-ODN的合成步骤概述

CY3-AS-ODN（Cy3-labeled Antisense Oligodeoxynucleotide）是指在反义寡核苷酸（AS-ODN）结构中引入花菁染料CY3，以赋予该寡核苷酸分子荧光特性，实现其在分子追踪、杂交实验、细胞成像及生物材料构建中的可视化应用。CY3 是一种具有强烈吸收与发射特性的三甲基花菁类染料，激发波长约550 nm，发射波长约570 nm，具有良好的光稳定性、信噪比高和摩尔消光系数大等优点。CY3-AS-ODN保留了原寡核苷酸的识别能力，同时具备高灵敏度荧光信号，是分子生物、纳米技术及生物物理领域的重要研究工具。

CY3-AS-ODN的合成主要包括两个核心阶段：寡核苷酸链的化学合成以及荧光染料的标记步骤。

寡核苷酸合成阶段：

AS-ODN一般采用固相合成法（Solid-Phase Phosphoramidite Method）在自动化合成仪上完成。通过四种核苷酸磷酰胺单体（A、T、C、G）在控制的条件下逐步延伸，每步包括脱保护、偶联、氧化和封端等过程。链合成完成后，通过氨解或碱性脱保护处理，释放目标ODN并去除保护基团，接着通过HPLC或PAGE进行纯化。

CY3标记步骤：

CY3染料的引入方式主要有两种：一是在寡核苷酸合成时直接使用含有CY3基团的修饰性磷酰胺单体或固相连接臂，进行“在线”标记（通常在5’端）；二是通过后期修饰方式，即在合成好的ODN上预留氨基修饰位点（如5’-amino modifier C6），然后使用CY3-NHS酯进行后修饰。后者是常用方法，其反应通常在碱性缓冲液（如0.1 M NaHCO₃, pH 8.5）中进行，CY3-NHS酯与寡核苷酸上的伯胺发生酰胺化反应，形成稳定的共价连接。

纯化与验证：

反应完成后通过乙醇沉淀、HPLC（反相或离子交换）或PAGE纯化去除游离染料及副产物。终产物的纯度和标记效率可通过紫外-可见光谱（OD260与OD550的比值）及质谱等方法进行分析确认。

CY3-AS-ODN因其结构稳定、荧光性能优越及合成灵活，常用于杂交成像、核酸传感器、荧光纳米探针等场景，具有高度可定制性与适应性。

产品名称：CY3-AS-ODN

纯度：95%+

规格：mg/g

用途：科研

状态：固体/粉末/溶液

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仅用于科研，不能用于人体。小编axc