生物素化核苷酸用于荧光原位杂交 (FISH)、DNA 阵列、微阵列

生物素化核苷酸

生物素修饰的三磷酸核苷类似物，如 dUTP 和 dCTP，可以通过酶促整合到 DNA 或 RNA 片段中，用于荧光原位杂交 (FISH)、DNA 阵列、微阵列和其他杂交技术。

标准酶促非放射性DNA标记反应，包括3'末端标记、cDNA 标记、切口平移、PCR和随机引物标记。每个生物素化核苷酸在生物素与其在核苷酸上的连接点之间包含一个 11、14、16 或 20 个原子的间隔区。例如常见的Biotin-dATP或Biotin-dCTP被用于HiC实验添加到酶切口处；生物素标记的linker(21bp dsDNA)可用于ChIAPET实验中连接两个染色质DNA片段；在RNA pull down实验中用生物素标记RNA（SP6或T7体外转录过程中，以Biotin-16-UTP部分取代UTP，从而转录生成生物素标记的RNA探针或mRNA。

由于使用的RNA Polymerase对天然核苷酸(NTP)和生物素标记核苷酸(Biotin-NTP)没有选择倾向性，因此每个RNA转录产物生物素标记的程度可以通过调节转录反应中NTP与Biotin-NTP的比例来控制。一些试剂盒将Biotin-16-UTP的比例控制在约35%，使反应和标记效率之间达到较好的平衡。得到的生物素标记的RNA探针或mRNA可使用荧光基团、酶或抗体偶联的链霉亲和素(Streptavidin)进行检测，应用与RNA pulldown或其他富集实验。