CY5标记嘧啶化合物，CY5-Cytarabine的反应条件
CY5标记嘧啶化合物，CY5-Cytarabine的反应条件
CY5-Cytarabine是一种将近红外荧光染料CY5通过共价偶联与核苷类药物阿糖胞苷（Cytarabine, Ara-C）形成的功能化分子。阿糖胞苷是一种脱氧核糖核苷类药物，由胞嘧啶碱基和脱氧核糖组成，其结构中含有3'-羟基和4'-羟基官能团，为荧光染料偶联提供活性位点。CY5染料的引入使分子具有近红外荧光信号（激发约650–670 nm，发射约670–690 nm），可用于细胞摄取追踪、核酸代谢研究及荧光成像实验，同时保持阿糖胞苷的核苷模拟特性。
反应条件
反应溶剂
通常使用极性有机溶剂，如二甲基亚砜（DMSO）、二甲基甲酰胺（DMF），或缓冲水/有机混合体系，以保证CY5染料和Cytarabine的溶解性。
水相体系可用于较低浓度反应，但需调节pH保持羟基活性。
pH条件
弱碱性环境（pH 7.5–9.0）最为适宜，促进Cytarabine羟基或氨基对CY5-NHS酯或CY5-异硫氰酸酯的亲核加成反应。
维持适中pH可提高偶联效率，同时保护核苷骨架不被降解。
温度与时间
室温至略高温（20–37°C）条件下反应数小时至过夜，可有效完成偶联。
低温可减少荧光染料的光漂白和副反应，同时维持产物稳定性。
偶联方式
酰胺化反应：CY5-NHS酯与Cytarabine羟基或氨基反应，形成稳定酰胺键。
硫脲化反应：CY5-异硫氰酸酯与Cytarabine氨基反应生成硫脲键，反应迅速且产物稳定。
在反应过程中，可加入缓冲盐或轻碱调节反应速率，避免CY5自聚或降解。
纯化与鉴定
反应结束后，可通过高效液相色谱（HPLC）、透析或凝胶过滤去除未反应染料及低分子杂质。
最终产物通过质谱（MS）、核磁共振（NMR）、紫外-可见光光谱和荧光光谱进行结构确认和荧光性能验证。
三、实验用途
细胞摄取与DNA代谢追踪
CY5-Cytarabine可进入细胞内，并模拟核苷代谢，荧光信号可用于监测DNA合成活跃区及细胞周期阶段。荧光成像与定位研究
CY5长波长荧光适合体内和体外成像，便于观察分子在细胞质和细胞核内分布，实现分子追踪。分子探针与药物筛选
CY5-Cytarabine可作为核苷模拟探针，用于核酸代谢酶活性检测、药物靶点筛选及药物动力学研究。纳米载体与递送系统研究
CY5-Cytarabine可修饰于纳米载体表面，用于研究药物递送路径、分布及释放动力学。
产品名称：CY5标记嘧啶化合物，CY5-Cytarabine
纯度：95%+
规格：mg/g
用途：科研
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仅用于科研，不能用于人体。小编axc