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5' Phosphorylating Amidite的化学研究

2025-11-28 分享

5' Phosphorylating Amidite的化学研究

5' Phosphorylating Amidite,中文名称可表述为 5' 磷酸化氨基化单体,是一种用于核酸化学合成的活性中间体,主要用于在寡核苷酸合成过程中实现 5' 末端磷酸化修饰。该类化合物广泛应用于 DNA、RNA 及其衍生物的化学合成、寡核苷酸功能化以及分子生物学实验,是核酸化学和生物分子工程中的关键试剂之一。其化学结构特点包括含有氨基保护基的磷酰胺或磷酰胺酯部分,能够与寡核苷酸 5' 末端的羟基发生可控的磷酸化反应,为后续连接修饰、标记或酶学反应提供磷酸化位点。

化学研究与反应特性如下:

  1. 分子结构与活性中心
    5' Phosphorylating Amidite 分子通常由磷原子、氮保护基、乙酰氧或其他保护基组成。磷原子在分子中具有三价结构,通常连接两个烷氧基或氨基保护基,以防止在储存和操作过程中不必要的副反应。氨基保护基的引入能够提高化学稳定性,同时保证在特定条件下可被选择性去保护,释放活性磷酸化功能,实现高效偶联。

  2. 寡核苷酸合成中的应用
    在固相寡核苷酸合成中,5' Phosphorylating Amidite 用于在合成链的 5' 末端引入磷酸基团。传统 DNA 合成方法通常在链末端形成羟基,利用 5' Phosphorylating Amidite 可以在链末端直接引入保护型磷酸基,经去保护后生成 5' 磷酸化寡核苷酸。这种修饰对于后续寡核苷酸连接、环化、标记或酶切反应至关重要。

  3. 反应条件与机理
    5' Phosphorylating Amidite 与寡核苷酸 5' 羟基在固相合成条件下通过活化剂(如偶氮二异丁腈或三氟乙酸等)催化,生成中间活性磷酰胺或磷酸酯,再经氧化步骤形成稳定的磷酸键。整个反应通常在惰性溶剂中进行,避免水分导致磷酰胺水解,同时确保反应高选择性和高效率。随后进行去保护和氧化,使 5' 末端磷酸化完成。

  4. 保护基策略
    为保证磷酸化 Amidite 在储存和反应中的稳定性,通常采用 N-保护基、酰氧基或硅烷基保护磷酰胺氨基。这些保护基在氧化和脱保护条件下可选择性移除,不影响寡核苷酸链的完整性。保护基策略是该类化合物高效应用于化学合成的关键之一。

  5. 生物和化学研究意义
    5' 磷酸化是寡核苷酸进行多种化学修饰、连接或环化的前提。例如,磷酸化寡核苷酸可用于连接标记分子、荧光探针、修饰核酸纳米结构或进行 DNA/RNA 连接反应。此外,磷酸化末端对于核酸酶(如连接酶、核酸内切酶)识别和作用是必需的,这使得 5' Phosphorylating Amidite 在生物化学、分子生物学及核酸药物开发中具有重要价值。

  6. 操作与稳定性
    5' Phosphorylating Amidite 通常在干燥、低温、避光条件下储存以保持活性。其在有机溶剂中稳定,可通过固相合成自动合成仪进行标准操作。偶联完成后,通过去保护和氧化步骤即可获得功能性 5' 磷酸化寡核苷酸,用于后续实验或应用。

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产品名称:5' Phosphorylating Amidite

纯度:95%+

规格:mg/g

用途:科研

厂家:良林生物

5' Phosphorylating Amidite

产品目录

花菁染料CY3标记油酸 CY3-Oleic acid/OA

花菁染料CY3标记右旋糖酐 CY3-Ficoll

花菁染料CY3标记鱼精蛋白 CY3-Protamine

花菁染料CY3标记脂多糖 CY3-LPS

花菁染料CY3标记重组蛋白A CY3-Recombinant Protein A

仅用于科研,不能用于人体。小编axc