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5'-DMT-dU Amidite,5'-DMT-dU 亚磷酰胺的性状与结构特点

2025-12-23 分享

5'-DMT-dU Amidite,5'-DMT-dU 亚磷酰胺的性状与结构特点

5'-DMT-dU Amidite 的中文名称通常为5'-二甲氧基三苯甲基保护脱氧尿苷亚磷酰胺化物,简称5'-DMT-dU 亚磷酰胺。其中,dU 表示脱氧尿苷(deoxyuridine),5' 位羟基被 DMT(Dimethoxytrityl,二甲氧基三苯甲基)保护,以防止在固相合成中发生非特异性反应;Amidite 表示该分子含有活性磷酰胺功能,可用于固相寡核苷酸合成,将 dU 单元有效引入寡核苷酸链中。

二、性状

  1. 物理性状
    5'-DMT-dU Amidite 通常为白色至淡黄色粉末,干燥、无臭或轻微芳香气味。其粉末形态便于长期低温储存和称量操作。产品溶于有机溶剂如乙腈(ACN)、二氯甲烷(DCM)等,但在水中稳定性较差,因此在使用过程中通常溶解于无水有机溶剂中进行偶联反应。

  2. 化学稳定性
    在干燥和避光条件下,5'-DMT-dU Amidite 化学性质稳定,可长期储存。其磷酰胺结构在无水、惰性条件下稳定,但在水或酸碱条件下易水解,因此在操作和储存中需保持干燥并避免强酸碱环境。DMT 保护基增加了分子在合成循环中的选择性和稳定性。

三、结构特点

  1. 磷酰胺功能
    5'-DMT-dU Amidite 的磷酰胺(P(III))中心为固相寡核苷酸合成提供活性位点,可与前一寡核苷酸链的 5'-羟基发生亲核偶联,形成磷酸二酯键。偶联过程中通常使用四唑类活化剂,反应温和、高效。

  2. DMT 保护基
    5' 位羟基的 DMT 保护基通过酸可脱保护,保证在合成循环中顺序控制寡核苷酸链的延伸,同时避免非特异性偶联。DMT 基团的存在还便于合成过程中通过紫外可监测脱保护效率。

  3. 尿苷碱基结构
    dU 单元为脱氧尿苷,碱基为尿嘧啶,通过 β-N1 糖苷键与脱氧核糖连接。碱基在磷酰胺偶联和寡核苷酸延伸过程中保持化学稳定性,并在 DNA 合成中可用于替代胸腺嘧啶,实现特定的碱基设计。

四、功能与应用

  1. 固相寡核苷酸合成
    5'-DMT-dU Amidite 是 DNA 寡核苷酸合成中的标准单体,可通过磷酰胺化反应将 dU 单元顺序引入寡核苷酸链中,用于 PCR 探针、引物或功能化 DNA 的制备。

  2. 修饰与标记
    通过 dU 的碱基或糖环位点,可进一步进行功能化修饰,例如荧光标记、交联剂连接或生物素化,使合成的寡核苷酸可用于荧光探针、分子成像和生物检测。

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产品名称:5'-DMT-dU Amidite

纯度:95%+

规格:mg/g

用途:科研

厂家:齐岳生物

5'-DMT-dU Amidite

产品目录

Cy3-MAL,Cyanine 3-MAL

Cy3-alkyne,Cyanine3-alkyne

Cy3-N3,Cyanine3-N3

CY5.5-聚乙二醇-氨基,Cyanine5.5-PEG-NH2

CY5.5-聚乙二醇-二苯基环辛炔,Cyanine5.5-PEG-DBCO

仅用于科研,不能用于人体。小编axc