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Spacer 9 Amidite,Spacer 9 亚磷酰胺的结构特点

2025-12-29 分享

Spacer 9 Amidite,Spacer 9 亚磷酰胺的结构特点

中文名称:Spacer 9 亚磷酰胺
(亦称:Spacer 9 核酸间隔基团)

英文名称:Spacer 9 Amidite
(Spacer 9 Phosphoramidite)

Spacer 9 Amidite 是一种在寡核苷酸合成中使用的功能性间隔化学试剂,用于在 DNA、RNA 或其他核酸探针序列中引入非核苷酸间隔单元。其主要作用是调控寡核苷酸的空间结构、柔性和可达性,从而改善寡核苷酸在标记、探针杂交或表面固定中的性能。Spacer 9 的结构通常为含有多亚甲基链的柔性间隔,具有良好的化学稳定性和水溶性。

  1. 结构特点

    • Spacer 9 Amidite 含有可参与固相合成的亚磷酰胺(phosphoramidite)官能团,可直接在 DNA 合成过程中通过标准的固相合成策略偶联到寡核苷酸链上。

    • 间隔部分由约九个亚甲基(–CH₂–)组成的柔性链构成,提供足够的空间距离,减少标记分子与核酸链的空间干扰。

    • 其柔性链可在核酸探针与靶标结合或功能团修饰时提供空间缓冲,避免 steric hindrance(空间阻碍)。

  2. 应用功能

    • 标记和修饰:Spacer 9 可在寡核苷酸的 5' 末端、内部或 3' 末端引入,为荧光染料、生物素、荧光素、荧光素衍生物或其他化学功能团提供连接位点。

    • 探针优化:通过调节 Spacer 9 的数量和位置,可以改善探针的杂交效率、灵活性和信号强度。

    • 表面固定:在微阵列芯片或纳米材料表面固定寡核苷酸时,Spacer 9 提供柔性连接,使探针远离表面,提高靶分子结合效率。

  3. 化学稳定性与兼容性

    • Spacer 9 Amidite 可耐受固相核酸合成中的标准去保护和氧化条件,保证合成过程的高效性。

    • 在水溶液和有机溶剂中具有良好溶解性,适用于多种修饰和偶联反应。

    • 偶联后的 Spacer 9 与寡核苷酸形成稳定的磷酸二酯键,不影响核酸链的整体稳定性。

  4. 使用优势

    • 提供高度灵活的间隔长度(9 个亚甲基单位),可优化标记分子或探针的空间构型。

    • 改善荧光染料或其他官能团的暴露度和信号检测效率。

    • 可与多种荧光染料、修饰基团和固相载体兼容,实现多功能寡核苷酸设计。

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Spacer 9 Amidite

产品目录

CY5-聚乙二醇-UTP

Cyanine5-PEG-UTP

CY5-聚乙二醇-α-糜蛋白酶

Cyanine5-PEG-α-Chymotrypsin

CY5-聚乙二醇-白藜芦醇

Cyanine5-PEG-Resveratrol

CY5-聚乙二醇-波形蛋白

Cyanine5-PEG-SPA

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