Cy5-COOH，1032678-07-1，花菁染料CY5标记羧酸的合成步骤概述

Cy5-COOH，1032678-07-1，花菁染料CY5标记羧酸的合成步骤概述

Cy5-COOH是一种以花菁染料Cy5为核心、末端含羧酸功能基团的荧光标记化合物。其末端羧基可进一步与氨基、羟基或其他活性基团发生共价偶联，实现生物分子或材料的功能化。Cy5-COOH应用于荧光探针制备、生物标记及化学偶联研究。

合成步骤概述：

核心染料合成：

首先合成Cy5核心结构，包括两端苯基和吡咯啉环，通过缩合反应形成共轭体系。

在共轭体系中引入可反应官能团（如氨基、羟基），为后续羧基修饰提供位点。

此阶段需控制温度和反应时间，以保证荧光特性不受破坏。

羧酸基团引入：

通过酯化或酰化反应将羧酸前体偶联到Cy5核心上。

常用策略包括用羧酸活化剂（如EDC/NHS）将羧基转化为活化酯，再与Cy5上的活性位点反应形成稳定的酰胺或酯键。

反应在缓冲溶液或有机溶剂中进行，pH略偏中性至弱碱性，以维持荧光染料稳定性。

偶联调控与保护策略：

为防止多位点修饰，可采用保护基团策略临时屏蔽非目标位点。

通过摩尔比控制，调节羧基标记度，避免荧光猝灭或分子间交联。

纯化与收集：

反应完成后，通过反相高效液相色谱（HPLC）或柱层析分离目标产物。

去除未反应的Cy5染料或多余羧酸，实现高纯度产品 (>95%)。

产品通常为深蓝色固体或油状物，溶于有机溶剂和缓冲液中，便于后续偶联应用。

表征方法：

通过质谱（MS）验证分子量与结构完整性。

核磁共振（NMR）用于确认羧酸官能团的成功引入。

紫外-可见光谱及荧光光谱用于检测吸收和发射性能，确保荧光特性保持稳定。

产品名称：Cy5-COOH

纯度：95%+

规格：mg/g

用途：科研

状态：固体/粉末/溶液

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仅用于科研，不能用于人体。小编axc