​CY3-6-N3，花菁染料CY3标记6-叠氮，纯化与表征

CY3-6-N3，花菁染料CY3标记6-叠氮，纯化与表征

CY3-6-N3的中文名称可表述为“6-叠氮修饰花菁染料CY3”，其中“CY3”表示花菁类染料分子，具有激发波长约为550纳米、发射波长约为570纳米的光学特性，适用于分子标记、荧光成像和生物追踪实验；“6-N3”表示在染料分子第6位引入叠氮官能团，为后续点击化学偶联提供高活性位点。CY3-6-N3是一种兼具光学信号和化学功能的多功能分子，广泛应用于蛋白质、核酸、纳米材料及其他生物分子功能化实验。

CY3-6-N3的纯化是确保染料活性和光学性能的关键步骤。合成过程中可能存在未反应的CY3染料、低分子量副产物或残余反应试剂。常用的纯化方法包括高效液相色谱（HPLC）、硅胶柱层析及溶剂沉淀法。HPLC纯化通常采用反相柱，利用水-乙腈梯度溶液对染料进行分离，可实现高纯度和高回收率；溶剂沉淀法则利用冷乙醚或丙酮将染料从反应溶液中析出，通过重复溶解-沉淀循环去除低分子量杂质；硅胶柱层析可根据极性差异分离目标产物，进一步提高纯度。纯化过程需在避光条件下进行，以避免CY3染料光降解或自聚合。

表征步骤是验证CY3-6-N3结构完整性和功能活性的必要环节。核磁共振氢谱（^1H NMR）可检测染料核心结构以及第6位叠氮引入的特征信号，从而确认官能化成功；质谱分析（MALDI-TOF或ESI-MS）可测定分子量及纯度，确保末端叠氮官能团完整；紫外-可见光谱（UV-Vis）用于确认染料吸收峰，典型吸收峰约在550纳米左右；荧光光谱则用于检测发射强度和波长，评估光学性能是否保持。红外光谱（FTIR）可辅助确认叠氮基特征吸收峰（2100–2150 cm⁻¹），进一步证明官能化成功。

纯化和表征后的CY3-6-N3具有高反应活性和稳定光学性能，可用于点击化学反应（CuAAC）或无铜应变促进点击反应（SPAAC）与叠氮配体修饰的目标分子共价偶联。PEG或其他柔性连接链可用于增加末端叠氮的可及性，降低空间位阻，提高偶联效率。在蛋白质标记实验中，CY3-6-N3能够稳定地与蛋白质氨基或巯基偶联，实现高信噪比的荧光信号输出。在核酸标记、纳米颗粒功能化及多分子复合物构建中，叠氮官能团提供了高选择性和温和条件偶联的优势，使染料标记具有可控性和重复性。

此外，CY3-6-N3的纯化和表征确保染料在生物体系中稳定，减少光漂白和非特异性吸附风险。通过高纯度纯化和严格表征，可获得末端叠氮完整、光学性能稳定的染料分子，为细胞成像、分子追踪和纳米材料标记实验提供可靠基础。

总体而言，6-叠氮修饰花菁染料CY3（CY3-6-N3）是一种兼具光学信号和化学功能的多功能分子。其纯化方法包括高效液相色谱、溶剂沉淀和柱层析，表征方法涵盖^1H NMR、质谱、UV-Vis、荧光光谱及FTIR。高纯度CY3-6-N3在点击化学反应、蛋白质及核酸标记、纳米材料功能化及分子追踪实验中具有高选择性、可控性和光学稳定性，是生物化学和材料科学研究中的重要实验工具。

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产品名称：CY3-6-N3

纯度：95%+

规格：mg/g

用途：科研

厂家：良林生物

产品目录

花菁染料CY5.5标记二氢卟吩 Cy5.5-Ce6

花菁染料CY5.5标记二油酰基磷脂酰乙醇胺 CY5.5-DOPE

花菁染料CY5.5标记甘氨胆酸 CY5.5-Glycocholic acid

花菁染料CY5.5标记甘氨鹅脱氧胆酸 CY5.5-GCDCA

仅用于科研，不能用于人体。小编axc