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BHQ-1 Phosphoramidite,BHQ-1-亚磷酰胺的合成步骤概述

2025-12-02 分享

BHQ-1 Phosphoramidite,BHQ-1-亚磷酰胺的合成步骤概述

BHQ-1 Phosphoramidite(BHQ-1-亚磷酰胺)是一种专用于寡核苷酸化学合成的荧光淬灭剂衍生物,属于Black Hole Quencher系列。其核心为高效非发光淬灭剂BHQ-1,可宽谱吸收可见光波段的荧光染料能量而不发射光,实现非辐射淬灭。BHQ-1 Phosphoramidite通过亚磷酰胺官能团连接到核苷酸或寡核苷酸的磷酸骨架上,实现淬灭基团在固相合成过程中的高效掺入,使得荧光探针、FRET体系和分子开关的构建成为可能。

化学结构特征

BHQ-1 Phosphoramidite分子主要包括三个组成部分:

  1. 淬灭核心
    BHQ-1芳香族共轭体系为分子提供宽光谱吸收(约480–580 nm),其非发光特性确保在FRET或荧光探针体系中高效能量转移而不产生背景光信号。

  2. 连接链
    淬灭核心通过柔性连接链与亚磷酰胺基团相连。该链段提供空间自由度,减少淬灭核心对目标寡核苷酸的空间阻碍,同时保证淬灭效率和化学稳定性。

  3. 亚磷酰胺活性基团
    亚磷酰胺(–P(OR)₂–NR₂)官能团是固相寡核苷酸合成的关键反应位点。通过该基团,BHQ-1可在DNA或RNA合成过程中与5'-羟基核苷酸发生磷酰胺键偶联,实现淬灭基团的特定掺入。亚磷酰胺基团在干燥、有机溶剂条件下稳定,同时在氧化剂存在下可形成磷酸酯,确保寡核苷酸骨架完整性。

合成步骤概述

BHQ-1 Phosphoramidite的合成通常包括以下几个关键步骤:

  1. BHQ-1羧酸衍生物制备
    以BHQ-1羧酸为前体,通过保护和修饰策略,保留芳香淬灭核心结构,同时在分子末端引入适合连接亚磷酰胺的官能团(如氨基或醇基)。

  2. 活化与连接
    将BHQ-1羧酸与含磷酰胺基团的活性衍生物偶联,通常通过酰胺键或酯键连接方式完成。该步骤在无水、有机溶剂中进行(如二氯甲烷、DMF),温和条件下避免芳香核心降解,并保留亚磷酰胺活性。

  3. 磷酰胺化反应
    偶联后的BHQ-1衍生物通过磷酰胺化反应引入磷酰胺基团,形成BHQ-1 Phosphoramidite。亚磷酰胺基团需保持对空气和水分敏感的稳定状态,以便后续在固相DNA或RNA合成中使用。

  4. 纯化与表征
    合成产物通过高效液相色谱(HPLC)纯化,去除未反应前体、副产物及残余试剂。产物表征常采用质谱(MS)、核磁共振(NMR)及紫外-可见光谱(UV-Vis),确认BHQ-1淬灭核心完整、亚磷酰胺基团活性以及分子纯度。

名称:BHQ-1 Phosphoramidite

纯度:95%+

规格:mg/g

用途:科研

厂家:良林生物

BHQ-1 Phosphoramidite

产品目录

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CY2标记异麦芽六糖 CY2-Isomaltohexaose

CY2标记异麦芽三糖 CY2-Isomaltotriose

CY2标记异麦芽四糖 CY2-Isomaltotetraose

CY2标记异麦芽糖 CY2-Isomaltose

仅用于科研,不能用于人体。小编axc