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C3 Spacer Amidite (DMT-1,3-Propanediol) 用于固相寡核苷酸合成的功能性修饰试剂

2025-12-17 分享

C3 Spacer Amidite (DMT-1,3-Propanediol) 用于固相寡核苷酸合成的功能性修饰试剂

C3 Spacer Amidite(DMT-1,3-Propanediol)是一种用于固相寡核苷酸合成的功能性修饰试剂,主要用于在寡核苷酸链中引入柔性间隔单元。其核心结构为 1,3-丙二醇(1,3-propanediol)连接至寡核苷酸,通过 DMT(Dimethoxytrityl)保护基保护羟基,实现与前一核苷磷酰胺化偶联。C3 Spacer 不含碱基,其功能在于提供可控长度的柔性间隔,使寡核苷酸在引入荧光染料、修饰基团或固相固定化时避免 steric hindrance,提高标记效率和分子功能性。

结构特点:C3 Spacer Amidite 由三部分组成:

  1. C3 连接链:三碳的柔性链结构提供适度间隔,使修饰基团与核酸主链空间隔开,减少对链杂交和酶识别的干扰。

  2. DMT 保护基:保护末端羟基,在固相合成中保证磷酰胺化偶联的选择性和效率,并可通过酸性去保护条件暴露羟基以进行下一步偶联。

  3. 磷酰胺化活性端:通过 2-氰乙基磷酰胺化形成可与前一核苷的 5′-羟基偶联的活性位点,实现链延伸。

结构合成主要包括以下步骤:

  1. 丙二醇的保护
    首先将 1,3-丙二醇的一个羟基通过 DMT-Cl(Dimethoxytrityl chloride)保护,形成 DMT-1,3-propanediol。DMT 保护基能够在后续固相合成过程中选择性去保护另一端羟基,保证偶联反应的可控性。

  2. 磷酰胺化
    将 DMT-1,3-propanediol 的自由羟基与 2-氰乙基氯化膦或其他磷酰胺化试剂反应,生成磷酰胺化中间体。这一步需要在干燥、无水条件下进行,以保证磷酰胺化端的活性和化学稳定性。

  3. 纯化与干燥
    磷酰胺化产物经过柱层析或高效液相色谱(HPLC)纯化,去除副产物和未反应的前体,得到高纯度、干燥且适合自动化寡核苷酸合成的 C3 Spacer Amidite。

良林生物供应磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、磁性纳米颗粒、纳米金、近红外荧光染料、荧光量子点、碳纳米管、石墨烯及多种功能高分子材料。如有需求可咨询

产品名称:C3 Spacer Amidite (DMT-1,3-Propanediol) 

纯度:95%+

规格:mg/g

用途:科研

厂家:良林生物

C3 Spacer Amidite (DMT-1,3-Propanediol)

产品目录

CY2标记阿兹夫定 CY2-Azvudine

CY2标记白桦脂酸 CY2-Betulinic acid

CY2标记丙泊酚 CY2-propofol

CY2标记丙烯酸羟乙酯 CY2-2-Hydroxyethyl acrylate

仅用于科研,不能用于人体。小编axc