5‑Carboxytetramethylrhodamine succinimidyl ester,5‑四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯
5‑Carboxytetramethylrhodamine succinimidyl ester,5‑四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯(5‑TAMRA‑SE),CAS:150810‑68‑7,分子量 527.60,为 5 位羧基单异构体四甲基罗丹明活性酯染料,区别于 5/6 混合异构体产物,单异构体拥有均一光谱行为,无异构体分离带来的批次波动问题。染料为暗红色固体,溶于 DMSO、DMF,激发波长 534 nm,发射波长 578 nm,呈现明亮橙红色荧光;罗丹明母核具备优秀抗光漂白性能,荧光几乎不受 pH 中性区间酸碱度扰动,不存在荧光素类染料酸性淬灭缺陷,适配复杂缓冲体系标记实验。琥珀酰亚胺酯基团在 pH7.2‑8.4 条件下选择性与伯氨基发生酰胺化,完成荧光共价接枝。
5‑TAMRA‑SE 更加适配多肽底物标记,相比于 6‑TAMRA 异构体,5 位羧基位置使得染料和多肽主链偶联之后,染料发色团远离多肽骨架,对多肽二级结构扰动更小,能够*大程度保留多肽原有理化行为与分子相互作用特性。多肽分子分子量小,空间紧凑,标记过程*易发生过度标记,多个荧光染料接枝到短肽链,引发分子内荧光自淬灭,荧光信号大幅衰减;因此多肽标记时染料摩尔投料建议控制 2‑5 倍区间,不可采用蛋白标记的高投料比。染料不溶于水,母液必须无水有机溶剂配制,再加入碳酸氢盐标记缓冲;NHS 酯在含水体系水解速度快,反应孵育时间不宜过长,减少水解副产物积累。
标记结束之后,借助反相色谱完成多肽‑染料共轭物纯化,依靠紫外双波长同时采集多肽吸收峰与染料特征吸收峰,追踪收集目标组分;可通过分光光度法计算每个多肽分子上染料标记数目。该染料标记产物适配凝胶荧光扫描、毛细管电泳、荧光光谱测试、共聚焦荧光检测等多种分析平台。试剂‑20℃避光干燥密封储存,建议分装单次使用规格,染料溶液光照条件容易发生光降解,配置母液全程避光操作。作为单异构体多肽专用荧光标记试剂,5‑TAMRA‑SE 为荧光多肽合成、多肽分子相互作用体外研究提供性能稳定的橙红色荧光标记方案。

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