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DBCO-Cy3 (DBCO-Sulfo-Cy3)的荧光标记方法

2024-09-25 分享

DBCO-Cy3 (DBCO-Sulfo-Cy3)的荧光标记方法

DBCO-Cy3 (DBCO-Sulfo-Cy3) 是 Cyanine3 fluorophore 的衍生物,是一种 pH (4-10) 不敏感的橙红色荧光染料 (orange fluorescent dye),激发波长和发射波长分别为 555nm和 580nm。Sulfo-Cy3 DBCO 反应动力学快,稳定性好,可用于多种标准荧光仪器。DBCO-Cy3 是一种点击化学试剂。它含有 DBCO 基团,可以和含有 Azide 基团的分子发生菌株促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。

DBCO-Cy3荧光标记方法主要基于点击化学的原理,特别是通过无铜点击反应(copper-free click reaction)实现Cy3荧光染料与DBCO(dibenzocyclooctyne)官能团的特异性共轭。这种反应具有高效、快速、无需铜催化剂的特点,适用于生物体内标记和成像。以下是DBCO-Cy3荧光标记方法的一般步骤:


一、实验准备

试剂准备:准备DBCO-Cy3荧光染料、目标蛋白质(或生物分子)、还原剂(如DTT,用于还原蛋白质中的二硫键)、缓冲液等。

设备准备:确保分光光度计、荧光光谱仪、离心机等实验设备处于良好状态。


二、蛋白质处理

蛋白质提取:通过细胞培养、细胞裂解、组织提取等方法获取目标蛋白质。

蛋白质纯化:采用适当的纯化方法(如亲和层析、离子交换层析等)去除蛋白质中的杂质。

浓度测定:使用BCA法、Bradford法等测定纯化后蛋白质的浓度。


三、DBCO连接

还原蛋白质:使用还原剂将蛋白质中的二硫键还原为自由巯基,这有助于后续的DBCO连接。

DBCO修饰:将DBCO官能团通过适当的化学反应(如酰胺化反应)连接到蛋白质分子上。这一步骤可能需要使用DBCO-PEG-NHS等连接剂,通过简单的反应将DBCO引入蛋白质。


四、Cy3荧光标记

染料溶解:将DBCO-Cy3荧光染料溶解在适当的溶剂中(如DMSO)。

荧光标记:将溶解后的DBCO-Cy3荧光染料加入到已经修饰有DBCO的蛋白质溶液中,使染料与DBCO发生点击反应,从而实现荧光标记。反应通常在室温下进行,时间根据实验条件而定,一般在15-60分钟之间。


五、后处理与检测

去除未反应物:使用蛋白质浓缩装置或其他方法去除未反应的染料和连接剂,同时将蛋白质浓缩。

标记效率检测:使用分光光度计或荧光光谱仪测定标记后蛋白质的荧光强度,以评估标记效率。


英文名称:DBCO-Cy3

分子量:983.18

分子式:C50H54N4O11S3

CAS:1782950-79-1

性状:固体

颜色:Purple to purplish red

结构式:

DBCO-Cy3


注意事项:

请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液;一旦配成溶液,请分装保存,避免反复冻融造成的产品失效。

储备液的保存方式和期限:-80°C, 6 months; -20°C, 1 month (stored under nitrogen)。-80°C储存时,请在6个月内使用,-20°C储存时,请在1个月内使用。